Bhè, la procedura corretta non è quella. Se non ti ha dato problemi, non significa nulla. Se installi moduli e cose varie, ma non vai a uppare le cartelle del modulo avrai sicuramente problemi.
Io ti consiglio di scaricare tuti i file dall'ftp e caricarli nel nuovo server, così avrai una copia esatta del sito. Non conviene mai spostare 1/4 di CMS
Ovviamente ricordati di modificare il file configuration.php con i nuovi dati del database, altrimenti non andrà :P
Ciauzz